Настройка менеджера обновлений

чтобы менеджер обновлений не раздражал неожиданным предложением об обновлении и только сообщал "стрелкой" в трее, что доступны новые обновления

отключает внезапное появление окна со списком доступных обновлений:
gconftool -s --type bool /apps/update-notifier/auto_launch false

задаёт интервал проверки доступных обновлений. По-умолчанию он равен 7 дней, мы же поставим 1 день:
gconftool -s --type int /apps/update-notifier/regular_auto_launch_interval 1

На этом можно остановиться, но есть ещё одна полезная опция, которую на мой взгляд нужно включить.

отображает с какой и на какую версию будут обновлены пакеты:
gconftool -s --type bool /apps/update-manager/show_versions true

(для версии 9.04)